Scientiae Studia, v. 3, número 02, 2005.
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Este número contém artigo de Pablo Lorenzano sobre "Ejemplares, modelos y principios en la genética clásica" e de Luiz Henrique de Araujo Dutra sobre "Os modelos e a pragmática da investigação". Contém também um texto de Paul Feyerabend sobre o problema da exitência das entidades teóricas, com introdução de Fernando Tula Molina; uma Nota Crítica sobre o darwinismo de Popper e uma resenha sobre o todo ser maior que a soma das partes.

Scientiae Studia, v.11, número 02, 2013.
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Este número contém uma discussão sobre "A noção de modelo na virada do século XIX para o o século XX" de Tatiana Roque & Antonio Videira; e a tradução do verbete "Modelo" por Ludwig Boltzmann, com introdução de Antonio Videira que apresenta a noção de modelo como realizando a síntese da concepção filosófica de Boltzmann. O número publica também uma análise estruturalista das teorias de Hill, elucidando a explicação na bioquímica.

Scientiae Studia, v. 14, número 01, 2011.
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Número especial dedicado a modelos, imagens e representações com discussões de amplo escopo que vão da contribuição das idealizações na ciência, passando pela modelização da comunicação e da aprendizagem ou os modelos mentais na ciência cognitiva, até os modelos de síntese de proteínas e as explicações modelares do câncer.